Ese ha sido el problema, pensaba que tenía una copia de seguridad, pero no está en el pendrive que suelo usar.
Y donde estaba la 2ª copia de seguridad, ha desaparecido porque estaba en el disco duro que murió.
He estado consultando y tengo dos opciones a probar suerte:
1ª reinstalar el sistema sobre la partición donde estaba y a ver si los puedo exportar.
2ª opción arrancar un sistema que lea el registro y me permita salvar los certificados.
En ambos casos, es a probar suerte si los lee.
La "putada" es que los certificados, a menos que se hayan exportado anteriormente desde el propio sistema no son "usables" en otro ordenador. Algo que debería de ser "de cajón" es que cada vez que se instala un nuevo certificado, se exportase a un fichero y guardarlo en lugar seguro en un pendrive o similar
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Pero los certificados GPG que había generado se perdieron porque estaban en otro directorio que no recordé salvar. 
¡Muchas gracias por la manita!