Te refieres a poner un logo en el video? si asi es puedes usar el virtualdub, spanishdub, etc y con el filtro "logo" insertarlo en el video.

O si lo quieres poner tipo subtitulos pues usa el subtitle workshop para crear un archivo de subtitulos que luego podras insertar en el video usando el filtro subtitle del virtualdub, spanishdub, etc.
Saludos...

Songoku

Puedes bajarte el Virtualdub de aquí http://www.hispamp3.com/programas/programa.php?programa=643 o de aquí http://spanish.doom9.org/index.html?/SSASubtitulo.htm

Y de aquí el Subtitle Workshop http://www.mundodivx.com/descargas.php

Saludos

Con el Subtitle Workshop creas el subtítulo pero no se lo insertas al video. Tienes la opción de reproducir el video para poder colocar los subtítulos donde corresponden pero no para insertárselos.
Se los podrás insertar con el Virtualdub, Virtualdubmod o Spanishdub.
Lo que tienes que hacer es guardar el subtítulo que has creado en formato ssa.
Sigue este tutorial para insertarle los subtítulos al video:
http://foro.elhacker.net/index.php/topic,21841.0.html

Saludos