Puedes quitarle el audio que no quieras con el Virtualdubmod, que te puedes bajar de aqui:
http://www.mundodivx.com/descargas.php?id=17

Cargas el capitulo y en la pestaña Video selecciona la opción "Direct Stream Copy".
Ve a la pestaña Stream y ve a la opción "Stream List", donde te aparecerán 2 pistas de audio, selecciona una de ellas, la que no quieras que se oiga y le das al boton Disable.
Y por ultimo guarda el avi.