Aqui os presento mi modesta y humilde obra. Pero cuan cariño le tengo XD. No mucho mas que decir, ya viene todo explicado en el source. Le he añadido las importaciones de java.util, ademas de un main, para que os sea mas facil probar la clase, si lo quieren como clase externa solo borren esto y ya esta.

/* AUTOR: d3n3k4 (Dnk!)
 * WEB: http://d3n3k4.blogspot.com/
 * FECHA: 01/DIC/2010
 * DESCRIPCION: 
 * 	- Contiene varias clases que realizan calculos matriciales como:
 * 		- suma y resta de matrices.
 * 		- producto de matrices.
 * 		- calcular la matriz transpuesta de una matriz.
 * 		- comprobar si dos matrices son iguales.
 * 		- comprobar si una matriz es cuadrada o no.
 * 		- comprobar si una matriz es simetrica.
 * 	- Se iran añadiendo mas funcionalidades, como multiplicacion por una constante,
 * 	  calcular determinante, rango, etc... y seran expuestas en mi web.
 * NOTA: Este codigo es libre y puede ser usado,modificado... siempre y cuando se
 * 	mantenga los creditos y comentarios del autor.
 */
import java.util.Scanner;
 
public class CalC {
	public static int[][] leeMatriz(int nFila, int nCol){
		int[][] matriz = new int[nFila][nCol];
		Scanner entrada = new Scanner(System.in);
 
		for (int i = 0; i < nFila; i++) {
			for (int j = 0; j < nCol; j++) {
				matriz[i][j] = entrada.nextInt();
			}
		}
		return matriz;
	}
	public static String escribeMatriz(int[][] matriz) {
		String mat = "";
		if (matriz != null) {
			for (int i = 0; i < matriz.length; i++) {
				mat += "|   ";
				for (int j = 0; j < matriz[0].length; j++) {
					mat += matriz[i][j] + "  ";
				}
				mat += "   |\n";
			}
		}
		return mat;
	}
	public static int[][] sumaMatrices(int[][] mat1,int[][] mat2,boolean resta) {
		int[][] matSal = null;
 
		if (mat1.length == mat2.length && mat1[0].length == mat2[0].length) {
			if (resta == true) { //cambia de signo mat2 para despues sea restada.
				for (int i = 0; i < mat2.length; i++) {
					for (int j = 0; j < mat2[0].length;j++) {
						mat2[i][j] = mat2[i][j] * -1;
					}
				}
			}
			matSal = new int[mat1.length][mat1[0].length];
			for (int i = 0; i < mat1.length; i++) {
				for (int j = 0; j < mat1[0].length; j++) {
					matSal[i][j] = mat1[i][j] + mat2[i][j];
				}
			}
		}
		return matSal;
	}
	public static int[][] transpuesta(int[][] mat1) {
		int[][] M_trans = new int[mat1[0].length][mat1.length];
 
		for (int i = 0; i < M_trans.length; i++) {
			for (int j = 0; j < M_trans[0].length;j++) {
				M_trans[i][j] = mat1[j][i];
			}
		}
		return M_trans;
	}
	public static int[][] productoMatriz(int[][] mat1,int[][] mat2) {
		int[][] matSal = null;
 
		if (mat1[0].length == mat2.length) {
			matSal = new int[mat1.length][mat2[0].length];
 
			for (int i = 0; i < matSal.length; i++) {
				for (int j = 0; j < matSal[0].length; j++) {
					for (int k = 0; k < mat2.length; k++) {
						matSal[i][j] += mat1[i][k] * mat2[k][j];
					}
				}
			}
		}
		return matSal;
	}
	public static boolean esIgual(int[][] mat1,int[][] mat2) {
		boolean igual = false;
 
		if (mat1.length == mat2.length && mat1[0].length == mat2[0].length) {
			igual = true;
			for (int i = 0; i < mat1.length; i++) {
				for (int j = 0; j < mat1.length; j++) {
					if (mat1[i][j] != mat2[i][j]) {
						igual = false;
					}
				}
			}
		}
		return igual;
	}
	public static boolean esCuadrada(int[][] mat1) {
		boolean cuadrada = false;
		if (mat1.length == mat1[0].length) {
			cuadrada = true;
		}
		return cuadrada;
	}
	public static boolean esSimetrica(int[][] mat1) {
		boolean simetrica = false;
		int[][] mat2 = transpuesta(mat1);
		if (esIgual(mat1,mat2)) {
			simetrica = true;
		}
		return simetrica;
	}
	public static void main(String[] args) {
		/*int[][] matriz1,matriz2,resultado = null;
		Scanner entrada = new Scanner(System.in);
		int filas = 0, columnas = 0;*/
 
		/*System.out.println("Introduce el numero de filas");
		filas = entrada.nextInt();
		System.out.println("Introduce el numero de columnas");
		columnas = entrada.nextInt();
		System.out.println("Introduce la primera matriz:");
		matriz1 = leeMatriz(filas,columnas);*/
 
		/*System.out.println("Introduce el numero de filas");
		filas = entrada.nextInt();
		System.out.println("Introduce el numero de columnas");
		columnas = entrada.nextInt();
		System.out.println("Introduce la primera matriz:");
		matriz2 = leeMatriz(filas,columnas);*/
 
		//resultado = sumaMatrices(matriz1,matriz2,true);
		//resultado = transpuesta(matriz1);
		//resultado = productoMatriz(matriz1,matriz2);
		/*if (resultado == null) {
			System.out.println("Error");
		}*/
		/*if (esIgual(matriz1,matriz2)) {
			System.out.println("Son iguales");
		} else {
			System.out.println("No son iguales");
		}*/
		/*if (esCuadrada(matriz1)) {
			System.out.println("Es cuadrada");
		} else {
			System.out.println("No es cuadrada");
		}*/
		/*if (esSimetrica(matriz1)) {
			System.out.println("Es simetrica");
		} else {
			System.out.println("No es simetrica");
		}*/
		//System.out.print(escribeMatriz(resultado));
	}
 
}
 

xDnk!
Recuerden respeten el autor