En el foro hay mucho hablado sobre lo que comentas, supongo que no habrás hecho una busqueda...

Dices que no te detecta la maquina el pendrive y que con otros no tienes problemas, has cambiado de puerto USB? Cuando lo conectas Windows no se inmuta? has mirado en el administrador de discos si te aparece? está en garantía?

Salu2

Sería interesante que indicaras la marca del pen. Una posible solución que me ha funcionado alguna vez, no todas es la entrar en la pagina del fabricante y descargar el driver de ese pen para Windows 98 SE, todas las marcas lo tienen, luego en una maquina en la que corras win 98 SE instala el driver y suele reconocerlo, procede a formatearlo en FAT  (16), una vez hecho esto ponlo en tu maquina normal y deberá reconocerlo, formatealo entonces en FAT32, y listo, resucitado.

No siempre funciona, pero vale lapena probarlo antes de tirarlo.

Si fuera Kingston esta sería la pagina:

http://www.kingston.com/ukroot/support/USBFLASHDRIVES/default.asp

Suerte.

salu2.