Haber:
La particion de linux la hago con qtparted de aproximadamente 6 gigas y con formato ext2, despues la de windows y por ultimo la swap que se recomienda en general sea de la mitad del tamaño de la cantidad de memoria ram de la que dispones, por ejemplo 1024 / la haces de 512, etc.
NOTA: las aprticiones deben ser PRIMARIAS
Luego de haber particionado, inicias con back track y vas a "inicio", system ->back track installer.

Despues me fijo en /mnt, a mi me da lo siguiente
floppy /live /sda1 (particion de win) /sda4 (particion de linux) /sda5 (back up)

Aunque en lo que lei en el source de la pantalla de instalacion siempre ponen /boot,
yo monto la unidad de cdrom:
mount /dev/hda /mnt/hda_cdrom

En la pantalla que te aparece:
Source(cd): /mnt/hda_cdrom
Install to.. : /mnt/sda4 (aca va la aprticion de linux)
Write MBR to: /dev/sda (referencia al disco duro)

Tildas la opcion de Real y le das a install

Luego reinicias.
Booteas del disco y tendria que empezar el Back Track ya que en la instalacion te mete lilo que es un gestor de booteo (loader), hay personas que se quejan de este loader, pero si lo configuras bien no tendras problemas.

Una vez que booteaste del disco duro con bt ejecuta kwrite y abre el archivo lilo.conf que se encuentra en /etc.
al final del mismo pegas lo siguente:


Guarda el archivo.

Ahora abre una consola y escribe liloconfig.
ve a expert, luego a view, ahi mismo te tendria que mostrar el archivo lilo.conf editado.
El paso anteriro era para verificacion.
Por ultimo en consola escribe lilo [enter].
tendria que salir:
Add bt *
Add WINDOWS
(no me acuerdo si es add o added)
NOTA: el asterisco indica (creo) cual es el SO que bootea por defecto.

Reinicias y el loader te tendria que mostrar:
bt
WINDOWS
.
Saludos.