Buenas:
     Por casualidad no habrás hecho algún tipo de cambio en la carpeta donde estan esos archivos ó cambiaste alguna propiedad?. Te lo digo porque en el caso de cifrado, la fuente se vuelve verde, y en azul creo que también si cambiabas en algún aspecto el estado de la carpeta, cambiaba.

Tienen razón, el color de la fuenta cambia cuando le das en las propiedades de la carpeta, supongo que le diste a todas las carpetas "Comprimir espacio para ahorrar espacio en disco", fíjate en las propiedades de alguna carpeta y si tiene esa opción activada es por eso, para quitar el color de la letra desactiva la casilla.

Podrías publicar la solución por si le ocurre a alguien más.
La solución es ir al Panel de Control > Opciones de carpeta > Pestaña Ver y desmarcar la opción "Mostrar con otro color los archivos NTFS comprimidos o cifrados.".