hola

yo paso unos parámetros por url en con la función window.open así:

window.open("factura_pdf.php?ced="+ced+"");

y me funciona perfecto, pero como hago para, de alguna u otra forma, cifrar o algo así, para que no se me muestren los datos que estoy pasando por url.

Si alguien me pudiese ayudar se lo agradecería.

base64_encode(datos)?
Debe pasarle la cadena "cifrada" al javascript, o hace cifrado base64 desde javascript directamente.