ami me gustan para un troyano las opciones:
notificador de cuando se a conectado la victima, con un listado en tiempo real de las victimas online y ofline, tipo messenguer
bouncer y la posibilidad de jugar a hacer cadenas entre las victimas conectadas
captura de pantalla offline, indicando la fecha, la hora; de inicio y de paro
posibilidad de manejar el pc, usando solo telnet( asi se puede usar desde cualquier ciber sin necesidad de bajar el cliente) en su defecto usando irc
busqueda de archivos automaticamente, ( usar el boton buscar y obtener los resultados )
cambiar el archivo de netstat por uno retocado

cambiar el comando dir para que no liste las carpetas que empiecen por . ( como en linux ) a lo rootkit
que pese 5k, y el mismo se encargue de descargar el server bruto de algun site
que tenga la opcion de usar comandos por php, sin conexion alguna, para transpasar en casos estremos el firewall y no dejar huella
no se, se me ocurririan muchas mas....

algunas de esas cosas las tengo que hacer yo "amano" y si las trajera por defecto el troyan te facilitaria la vida