Ejecutaste el server en tu PC? no creo que pase nada, porque el que tiene el control sobre el server eres tu. Abre el cliente y mira si se conecta y trata de desinstalarlo desde el cliente.
Otra manera es que sepas cuales son las modificaciones que hace el server en tu PC, tanto en el registro, como los archivos que se crean. Una vez que sabes estos datos entras a tu PC en modo a prueba de fallos (ya que está en agresive mode ésto es necesario) y luego borras o modificas esos cambios y vuelves todo a como estaba antes.
Si no estás seguro qué es lo que modifica y crea en tu PC ese server, dinos de qué server se trata, y puedo pasarte un programa en batch que elimine el troyano.